Расчет по страховым взносам: как исправить расхождение суммы уплаченных и начисленных взносов?

Добрый день. Я ИП на УСН 6%. Прошу помощи по отчету.
Возникли расхождения при формировании Отчета по страховым взносам за полугодие. За апрель была начислена зарплата 4545,45 (сотрудник вышел из отпуска и отработал всего два дня), с нее я рассчитала взносы в ПФР 22% как 999,99. Так и уплатила. А при формировании отчета программа выдает ошибку и расхождение как раз на 0,01 коп., то есть рассчитывает мне как 1000 рублей взносы. 
Как мне лучше поступить теперь? Отправить в отчете 1000 и сейчас просто доплатить за апрель недоимку? Или отправить отчет с ошибкой и ждать ответа налоговой? И если мне доплатить эти копейки, лягут ли они или уже по любому мне недоимку посчитают? Спасибо!